Вчені з Сінгапуру виявили нову кладу (тип) смертоносного грибка Candida auris, стійкого до більшості протигрибкових ліків, що збільшує загальну кількість кладів до шести.
Candida auris — збудник кандидозу, що легко передається і має високу стійкість до протигрибкових препаратів, що ускладнює його лікування. Цей умовно-патогенний мікроорганізм може бути частиною природної мікрофлори людини, не завдаючи шкоди. Однак він небезпечний для людей з ослабленим імунітетом та важкими супутніми захворюваннями, зокрема пацієнтів лікарень, які використовують інвазивні пристрої, такі як дихальні трубки та катетери. C. auris може довго виживати на різних поверхнях, зокрема на медичному обладнанні, і часто стає причиною внутрішньолікарняних інфекцій.
У 2023 році вчені виявили нову кладу C. auris у пацієнта Сінгапурської клініки загального профілю, який протягом двох років не виїжджав за межі країни. У співпраці з дослідниками з Сінгапурського інституту геному вони розробили метод машинного навчання для відстеження нової клади. Після реконструкції геномів виявленого патогена було підтверджено, що він належить до генетично відмінної клади.
Подальші дослідження архівів лікарні виявили ще два подібні випадки інфекції. Вчені перевірили стійкість нової клади до протигрибкових засобів і виявили, що вона чутлива до протестованих препаратів. Результати були опубліковані в журналі The Lancet Microbe.
Нова клада C. auris має генетичну спорідненість з представниками IV клади, яка переважно зустрічається в Південній Америці. Це відкриття вказує на раніше невідоме генетичне різноманіття та можливе місце походження C. auris.
Вчені наголосили на важливості клінічних спостережень, пошуку ефективних стратегій секвенування та генетичного аналізу для виявлення нових штамів C. auris, відстеження їхнього поширення та стримування несприятливих наслідків. Наразі дослідники розробляють експериментальну методику на основі машинного навчання, що дозволить автоматично виявляти нові клади на ранніх етапах, що є особливо актуальним для Сінгапуру, де щорічно прибувають мільйони іноземних гостей.