Дослідники виявили нові типи вірусоїдів, які заражають бактерії у кишечнику людини.
Вчені виявили клас вірусоподібних об’єктів, що раніше не зустрічався, які ховаються в кишечнику і ротовій порожнині людини. Ці вірусоїди можуть впливати на активність генів у нашому мікробіомі, повідомляє Science.
Дослідники підтвердили, що ці вірусоподібні сутності мають одного господаря — звичайну бактерію, виявлену в роті, під назвою Streptococcus sanguinis. Їм ще належить підтвердити наявність додаткових господарів, але вони вже підозрюють, що принаймні частина з них — бактерії.
Вірусоїди — – це крихітні петлі РНК, генетичні родичі ДНК. Раніше вчені виявили, що насамперед вони заражають рослини, такі як картопля. Вірусоїди відрізняються від більших вірусів на основі РНК за декількома параметрами. По-перше, вони не мають захисної оболонки, яку віруси використовують, щоб утримати генетичний матеріал. По-друге, в їх РНК немає інструкцій щодо побудови білків.
Раніше вважалося, що вірусоїди заражають лише рослини. Однак недавні дослідження показали, що вони заражають інших господарів, таких як тварини, гриби або бактерії. У новому дослідженні дослідники шукали можливі вірусоїди серед генів мікробів, що мешкають в організмі людини.
У звіті, опублікованому в базі даних препринтів bioRxiv, вчені розповіли про групу вірусоїдів, які вони виявили в кишечнику та роті людини, і назвали «обеліски». Усього вони ідентифікували близько 29960 прикладів вірусоїдів. Роботу ще не рецензували і вона не була опублікована в науковому журналі.
Їх назвали «обелісками», тому що вторинна структура вірусоїдів — тривимірна форма, яку вони приймають, складаючись усередину, — за прогнозами, виглядатиме як тонкий стрижень.
Використовуючи раніше опубліковані дані, дослідники вивчили дані про активність генів у різних мікробних угрупованнях в організмі. Ці зведення активності генів відомі як метатранскриптоми.
Вони виявили, що «обеліски» були присутні приблизно в 7% метатранскриптомів людських фекалій. Ці зразки випорожнень дали уявлення про активність генів у мікробіомі кишечника. Вчені також виявили нещодавно названі вірусоїди в 17 із 32, або приблизно в 53%, метатранскриптомів рота, які перевірили.