Іноді люди виглядають набагато молодше або старше свого фактичного віку. Вчені з Інституту Солка виявили генетичні сигнатури, які можуть допомогти пояснити цей феномен.
Вікові генетичні патерни були виявлені в результаті аналізу клітин шкіри, узятих у пацієнтів різних вікових груп. Отримані результати вчені використовували для виявлення ознак прискореного старіння у людей з прогерією — хворобою, із-за якої людина виглядає значно старше свого віку.
За словами вченого Сакета Навлакха, в подальших дослідженнях метод машинного навчання може бути розширений для з’ясування, коли люди починають старіти швидше. Це можна буде використовувати для лікування пацієнтів, які знаходяться у зоні ризику через вік, або для корекції їх способу життя до появи хвороб. Стаття про проведене дослідження опублікована в журналі Genome Biology.
Професор Навлакха стверджує, що проект почався з розмови з Мартіном Хетцером в Інституті Солка.
Вони розробили проект для вивчення даних без передумов про те, де будуть виявлені ознаки старіння. В результаті вийшов «чорний ящик» вікових передбачень. Він знайшов пов’язані з віком генетичні зміни, але не пояснив їх важливість.
Робота була виконана за допомогою вивчення молекул РНК в клітинах. РНК виробляється або транскрибується з ДНК. Неактивні гени не виробляють РНК. Таким чином, визначення того, які молекули РНК присутні або відсутні, допомагає з’ясувати статус відповідних генів.
Процес був проведений на клітинах, взятих у 133 людей у віці від одного року до 94 років. Дослідники використовували фібробласти шкіри.
Помістивши дані в алгоритм машинного навчання, вчені витягли патерни генної активності, які відповідно до віку збільшується. Використовуючи ці біомаркери, команда змогла передбачити вік людини з похибкою до чотирьох років.
Щоб підтвердити, що молекулярна сигнатура була справжньою, а не артефактом або збігом, дослідники застосували цей же процес машинного навчання до геномів десяти дітей у віці від двох до восьми років, які хворіють прогерією. Результат перевищував фактичний вік на 10 років.